В московском арбитраже "Роснефть" урегулировала судебный спор с люксембургской структурой ЮКОСа Yukos Capital, которая добилась того, что на сумму, предназначающуюся "Роснефти" от продажи литовской нефтеперерабатывающей компании Mazeikiu nafta, был наложен арест. Арбитражный удовлетворил заявление "Роснефти". Суд также взыскал с компании Yukos Capital S.a.r.l. расходы по уплате госпошлины.
В сентябре 2006 года Международный коммерческий арбитражный суд (МКАС) при Торгово-промышленной палате России постановил взыскать в пользу Yukos Capital S.a.r.l. с подконтрольного "Роснефти" "Юганскнефтегаза" более 490 млн долларов (около 13 млрд рублей) задолженности по выданным ранее кредитам.
В конце декабря 2006 года компания Yukos Capital убедила суд Амстердама арестовать счета, на которые поступят деньги от продажи Mazeikiu nafta, часть которых должна была попасть "Роснефти", на том основании, что принадлежащий теперь "Роснефти" "Юганскнефтегаз" не расплатился с долгами перед Yukos Capital.
